Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1bO70237 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1bO70237 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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