Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HcrtO55241 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HcrtO55241 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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HcrtO55241 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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HcrtO55241 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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HcrtO55241 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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HcrtO55241 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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