Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RngttO55236 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RngttO55236 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RngttO55236 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RngttO55236 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RngttO55236 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RngttO55236 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RngttO55236 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RngttO55236 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RngttO55236 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RngttO55236 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms