Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms