Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ldb2O55203 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ldb2O55203 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ldb2O55203 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ldb2O55203 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb2O55203 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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