Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlx3O55144 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms