Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms