Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg2O55111 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms