Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms