Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip3O55003 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms