Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LatO54957 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LatO54957 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LatO54957 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LatO54957 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LatO54957 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LatO54957 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LatO54957 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LatO54957 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LatO54957 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LatO54957 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LatO54957 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LatO54957 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LatO54957 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms