Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limk2O54785 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms