Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CrxO54751 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CrxO54751 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CrxO54751 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms