Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms