Protein–RNA interactions for Protein: O35701

Matn3, Matrilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn3O35701 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Matn3O35701 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Matn3O35701 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Matn3O35701 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Matn3O35701 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Matn3O35701 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms