Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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