Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms