Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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