Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms