Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms