Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc23O35125 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms