Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M9O19442 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M9O19442 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-M9O19442 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M9O19442 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms