Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1O19441 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q1O19441 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms