Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GclmO09172 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GclmO09172 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GclmO09172 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GclmO09172 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GclmO09172 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GclmO09172 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GclmO09172 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GclmO09172 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GclmO09172 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GclmO09172 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GclmO09172 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GclmO09172 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GclmO09172 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms