Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms