Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms