Protein–RNA interactions for Protein: O08740

Polr2j, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2jO08740 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2jO08740 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms