Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MttpO08601 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MttpO08601 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MttpO08601 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MttpO08601 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MttpO08601 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MttpO08601 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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MttpO08601 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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MttpO08601 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MttpO08601 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms