Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms