Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms