Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm21972J3QN38 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm21972J3QN38 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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