Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20918J3QN17 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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