Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms