Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21863J3KMP8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm21863J3KMP8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm21863J3KMP8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm21863J3KMP8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm21863J3KMP8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm21863J3KMP8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21863J3KMP8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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