Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm21897J3KMP5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm21897J3KMP5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm21897J3KMP5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21897J3KMP5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21897J3KMP5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21897J3KMP5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21897J3KMP5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm21897J3KMP5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm21897J3KMP5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm21897J3KMP5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21897J3KMP5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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