Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20828J3KMI7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms