Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pot1bH7BX60 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms