Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms