Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms