Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna9G3X8Z7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms