Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdh9F8VPK8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms