Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms