Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms