Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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