Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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