Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms