Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FancfE9Q5Z5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms