Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G0

Zscan4b, Zinc finger and SCAN domain-containing 4B, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zscan4bE9Q3G0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zscan4bE9Q3G0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zscan4bE9Q3G0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zscan4bE9Q3G0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Zscan4bE9Q3G0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Zscan4bE9Q3G0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Zscan4bE9Q3G0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Zscan4bE9Q3G0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Zscan4bE9Q3G0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zscan4bE9Q3G0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zscan4bE9Q3G0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zscan4bE9Q3G0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Zscan4bE9Q3G0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zscan4bE9Q3G0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zscan4bE9Q3G0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan4bE9Q3G0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Zscan4bE9Q3G0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zscan4bE9Q3G0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan4bE9Q3G0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms