Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms