Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms